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PolyPeptide, 삼성바이오로직스 인수 전 마지막 실적 발표에서 '깜짝 실적' 기록

2026년 상반기 실적 및 사업 업데이트 컨퍼런스 콜, 2026년 8월 13일

PolyPeptide Group이 상장사로서 마지막이 될 수도 있는 실적 발표를 통해 수익성 개선이라는 극적인 전환점을 알리고, 연간 가이던스를 상향 조정하며 삼성바이오로직스에 의한 인수 조건이 유효함을 재확인했다. 후안 호세 곤잘레스(Juan Jose Gonzalez) CEO는 "이번이 우리의 마지막 실적 발표가 될 수 있다"는 이례적으로 솔직한 언급으로 컨퍼런스 콜을 마무리했다. 취리히 증시에 상장된 펩타이드 위탁개발생산(CDMO) 기업인 PolyPeptide의 이번 실적은 삼성바이오로직스의 주당 44.31 CHF(스위스 프랑) 인수 제안의 전략적 타당성과, 지난 3년간 기업의 체질을 바꾼 GLP-1 기반 제조 붐의 저력을 입증했다.

대사질환 치료제 생산 규모 확대에 따른 마진 급증

이번 실적의 핵심은 마진 확대였다. EBITDA 마진은 2025년 상반기 2.7%에서 2026년 상반기 20.7%로 급등했다. EBITDA는 전년 동기 대비 41.6%(고정환율 기준 43.7%) 증가한 2억 3,660만 EUR의 매출을 기록하며 440만 EUR에서 4,910만 EUR로 상승했다. 팀 브란들(Tim Brandl) 임시 CFO는 이번 성과가 일회성이 아님을 분명히 했다. "핵심은 이번 수익성 개선이 구조적이라는 점입니다. 브레인(Braine) 공장의 대규모 SPPS(고상 펩타이드 합성) 설비 가동률 상승과 전사적인 운영 효율화가 주효했습니다." 무형자산 매각에 따른 일회성 이익 920만 EUR와 지속적인 ERP 투자 비용 480만 EUR를 제외하더라도, 조정 EBITDA 마진은 전년 대비 약 7배 수준인 18.9%를 기록했다.

대사질환 치료제 부문은 여전히 독보적인 성장 동력이다. 전년 대비 73% 성장한 이 부문은 전체 매출의 68%를 차지했다. 이는 회사가 상장했던 2021년 당시 25%였던 비중과 비교하면 비약적인 성장이다. 상업화 단계 매출은 새로 가동된 브레인 시설에 힘입어 35.8% 증가했으며, 향후 상업적 물량을 가늠하는 선행 지표인 개발 매출은 52.3%라는 더 빠른 성장세를 보였다.

가이던스 상향, 전 세계 임상 3상 펩타이드 프로젝트 절반 점유

상반기 실적 호조에 힘입어 경영진은 2026년 매출 성장률 가이던스를 기존 20~25%에서 25~30%로 상향 조정했다. EBITDA 마진 가이던스 역시 기존 '중상위권(mid-to-high teens)'에서 '상위권(high teens)'으로 높였으며, 자본 지출(CAPEX) 가이던스는 매출의 15~20% 수준으로 유지했다. 중기 목표인 '2028년까지 2023년 매출의 2배 달성 및 EBITDA 마진 25% 근접'은 변함없이 재확인했다.

파이프라인 데이터 중 가장 눈에 띄는 점은 후기 단계 프로젝트의 증가다. 임상 3상 프로젝트는 2025년 말 30개에서 2026년 중반 37개로 늘었다. 곤잘레스 CEO는 이를 전체 시장 규모와 비교해 설명했다. "전 세계적으로 개발 중인 임상 3상 합성 펩타이드 약물은 약 70개입니다. 이는 사실상 전 세계 임상 3상 개발 활동의 절반이 PolyPeptide를 통해 이루어지고 있다는 의미입니다." 경영진은 임상 3상 성장의 일부가 기존 PolyPeptide의 임상 2상 프로젝트가 진전된 결과일 뿐만 아니라, 경쟁사 CDMO들이 분자 복잡성 대응에 어려움을 겪으면서 개발 도중 프로젝트를 옮겨온 사례들도 포함되어 있다고 밝혔다.

삼성과의 인수 조건 재확인, 최대 주주 동의 확보

경영진은 지난 7월 20일 발표된 인수 절차를 재차 설명했다. 삼성바이오로직스는 PolyPeptide의 모든 발행 주식을 주당 44.31 CHF(현금)에 인수하기로 합의했다. 이는 인수설이 돌기 전 주가 대비 40%, 60일 거래량 가중 평균 가격(VWAP) 대비 60%의 프리미엄이 붙은 금액이다. 지분 55.65%를 보유한 최대 주주 프레데릭 폴센(Frederik Paulsen)은 이미 매각에 동의했으며, 이사회 내 이해관계가 없는 독립 사외이사들 또한 공정성 의견서를 바탕으로 만장일치로 인수를 권고했다. 경영진은 다른 주주들의 반응에 대해서는 말을 아꼈으며, 브란들 CFO는 "아직 투자설명서가 발행되지 않았고 공개 매수 기간도 시작되지 않았다"고 언급했다.

고객 반응에 대해 곤잘레스 CEO는 이번 인수가 사업 중단이 아닌 역량 강화의 기회라고 강조했다. "고객들은 이번 인수를 통해 PolyPeptide가 이전에는 확보하기 어려웠던 자원과 역량을 활용하여 규모를 확장할 수 있는 기회로 보고 있습니다." 그는 또한 투자자 협상 결과와 관계없이 벨기에, 토런스, 암베르나트 지역의 기존 시설을 활용한 설비 확장을 검토 중이라고 밝혔다. 특히 말뫼(Malmo)에서 검증된 모듈식 건설 방식을 적용할 경우, 대규모 확장을 착공부터 완공까지 약 2.5년 안에 완료할 수 있고 후속 모듈은 더 빠르게 진행될 것이라고 설명했다.

경쟁 환경: 중국 기업, 서방 시장 계약에서 배제

우시앱텍(WuXi AppTec)의 빠른 펩타이드 부문 성장세에 대한 질문에 곤잘레스 CEO는 데이터의 비교 가능성을 지적하며 반박했다. 우시의 보고 수치는 원료, 중간체, 완제품, 올리고뉴클레오타이드 등이 혼재되어 있어 펩타이드 특화 성장세를 분리하기 어렵다는 것이다. 더 중요한 점은 생물보안 우려로 인해 중국 CDMO들이 서방의 상업적 계약에서 완전히 배제되고 있다는 점이다. 그는 "서방 고객들과의 상업적 협상에서 우리는 오직 다른 서방 기업들과만 경쟁할 뿐, 중국 기업들과는 경쟁하지 않는다"고 단언했다. 반대로 PolyPeptide는 중국 내 입찰에 참여하지 않는다. 세마글루타이드 제네릭과 관련해서는 중국과 인도 제조사들의 영역으로 보고 진출 의사가 없음을 분명히 했다. 대신 매일 투여가 아닌 월 1회 투여 제형, 경구 투여, 개선된 효능 및 부작용 프로파일을 갖춘 차세대 대사질환 치료제에 집중하고 있으며, 이를 통해 MASH(대사질환 관련 지방간염), 심혈관 질환, 수면 무호흡증, 골관절염 등으로 적응증을 확대하고 있다고 밝혔다.

미국 내에서 부상하는 소비자용 펩타이드 시장에 대해서는 흥미롭게 지켜보고 있으나, 기존 제약 및 바이오 고객사들의 수요가 이미 PolyPeptide의 공급 능력을 초과하고 있어 단기적인 진출 계획은 없다고 덧붙였다.

2028년까지의 설비 확장 리스크 해소

브레인 공장은 현재 목표 가동률을 달성했으며 생산 수율은 계획을 상회하고 있다. 스트라스부르 공장은 2026년 하반기부터 가동을 시작할 예정이나, 올해 매출 기여도는 미미하며 2027년부터 본격적인 효과가 나타날 것으로 보인다. 회사의 첫 완전 모듈식 확장 프로젝트이자 약 1억 EUR가 투입된 말뫼 공장은 주요 대사질환 제약 파트너사의 자금 지원을 받아 2027년 가동을 목표로 순항 중이며, 해당 연도 말에는 목표 가동률에 도달할 것으로 예상된다. 상반기 투자 활동으로 인한 순현금흐름은 4억 5,800만 EUR로, 주로 스트라스부르와 말뫼 공장 완공에 사용되었다. 6월 말 기준 회사는 2억 EUR 규모의 회전신용대출 중 1억 EUR를 사용했으며, 5,900만 EUR의 현금을 보유하고 있어 삼성과의 인수 절차가 진행되는 동안에도 설비 확장을 지속할 수 있는 유연성을 확보했다고 경영진은 밝혔다.