2026年第3四半期アーニングズコール、2026年11月4日
戦略的獲得は本物だが、収益の伴いはこれから
PacBioは第3四半期の決算説明会において、低価格化したSPRQ-Nxケミストリーが、現在の収益基盤を上回る大規模なプログラムを開拓しつつあると主張した。最も重要な新展開は、GeneDxが希少疾患検査ポートフォリオにロングリード全ゲノム解析を追加する計画である。GeneDxは米国屈指の臨床ゲノミクス企業であり、今回の決定はHiFiにおける米国初の本格的な臨床現場での大型採用となる。経営陣は検査件数や時期について言及せず、売上高への貢献度については数値化されていない。マーク・ヴァン・オーン（Mark Van Oene）CEOは、発表後にASHG（米国人類遺伝学会）の参加者から「多大な関心」が寄せられたと述べた。
臨床向け分野は現在、PacBioの成長エンジンとなっている。TDコーウェンの質問に答える形で、ヴァン・オーン氏は臨床用消耗品の売上高が「前年同期比20%超」で成長しており、経営陣が最近言及していた10%台半ばから、現在は全体事業の20%を超えていると述べた。同氏はこれを「現在におけるPacBioの成長ドライバー」と表現した。EMEA（ヨーロッパ・中東・アフリカ）が臨床市場を牽引しているものの、ヴァン・オーン氏は欧州においても臨床向けは事業全体の半分未満に留まると指摘した。欧州の統合医療システムや、年間数千人の希少疾患患者を診る検査機関では、単一ワークフローの経済性を正当化しやすいためである。同社は現在、同様の論点を米国の検査機関にも持ち込んでいるが、その取り組みについては「初期段階」であると説明した。
バイオAIが事業の第2の柱に
経営陣は、バイオAI向けデータ層としての自社ポジショニングに、以前よりも重きを置いている。Verilyとの複数年にわたる提携により、Verilyの「Workbench」（2万人の研究者が利用）内にHiFi全ゲノムワークフローが組み込まれる。目的は、ロングリードデータと実際の臨床記録を統合し、AI対応のデータセットを構築することである。ヴァン・オーン氏によれば、発表以来、バイオバンク、バイオ製薬企業、医療システム、AIモデル開発者から関心が寄せられているという。財務条件は開示されていない。同氏は、価値はインフラストラクチャのライセンスにあるのではなく、「ゲノム科学、医療記録、AIをつなぐこと」にあると述べた。
またPacBioは、RNA治療薬の有効性やオフターゲット効果を予測するモデルのトレーニングに向け、1万を超えるサンプルでHiFiおよびKinnexフルレングスRNAシーケンシングを実行するため、TychoBioとの提携も発表した。Basecamp Researchの「Trillion Gene Atlas」に関する作業も継続しており、毎週何百ものサンプルが解析・納入されている。Basecamp社はこの四半期に1億4,000万ドルを資金調達しており、経営陣はこれを外部からの検証と位置づけた。これらのプログラムは1年前には存在していなかった。また、実質的な意味での収益貢献はまだ先であり、投資家はAIに関するストーリーを、近々の業績ドライバーではなく、将来のボリュームに対するオプションとして捉えるべきである。
SPRQ-Nxの採用は好調だが、当面は消耗品の売上を圧迫
当四半期におけるRevio消耗品売上の半分以上がSPRQ-Nxによるものであり、導入済み基盤の3分の2がソフトウェアをアップグレードした。経営陣は、年末までに大多数が移行すると予想している。20xヒトゲノムのリスト価格である345ドルは案件獲得パイプラインの中心であり、一部の顧客はこれを活用するために同一のサンプルプールを3回実行している。
財務成績は混在したものとなった。消耗品売上高は2,080万ドルとなり、前四半期の2,010万ドルから約3%増加したものの、前年同期の2,130万ドルからは減少した。最高会計責任者（CAO）のビル・メイヤー（Bill Meyer）氏は、その要因として、顧客が既存の試薬在庫を消化しつつ複数回使用のワークフローに移行していること、「シーケンシングの稼働が消耗品の購入よりも速いペースで増加していること」を挙げた。Revioのプルスルー（1台あたりの年間消耗品売上高）は年間換算で約20万4,000ドルであった。経営陣は2026年の予想レンジである20万〜22.5万ドルを据え置いたが、これは現在の下限付近に着地することを意味する。ヴァン・オーン氏は、約30%の価格引き下げ効果を吸収した上で、2027年にはプルスルーを22万5,000〜25万ドルのレンジに戻す見込みであると述べた。この予測はこれから証明される需要の価格弾力性に依存しており、SPRQ-Nxの第1陣の再注文が始まったのは今四半期からに過ぎない。
欧州と中国が牽引し、機器販売が回復
総売上高は4,060万ドルとなり、前年同期の3,840万ドルから6%増加、第2四半期の3,900万ドルを上回った。機器売上高は16%増の1,320万ドルに達した。PacBioのRevioシステムの出荷台数は、前年同期の13台から15台に増加し、Vegaシステムは、8月にVega向けSPRQ-Nxが発売され出力が60ギガベースから90ギガベースに向上したことを受け、前年同期比9%増、前四半期比35%増の35台となった。Berry Genomics社は、中国の5カ年国家出生欠損プログラムに向けて複数のRevioシステムによるフリートを構築しており、経営陣によればこれが40の病院に拡大する可能性があるという。Revioの導入台数の半分以上が新規顧客向けであり、Vegaの出荷では90%以上が新規顧客であった。
地域別の業績はまちまちであった。EMEAの売上高は、好ましい価格設定に支えられ30%増の1,400万ドルとなった。米州の売上高は1,820万ドルとほぼ横ばいだったが、NIH（米国立衛生研究所）や学術機関の資金調達の不確実性を背景に、機器売上高は約24%減少した。アジア太平洋地域の売上高は、前年同期比13%減、前四半期比19%増の830万ドルとなった。経営陣は、米州における学術および政府からの資金調達の本格的な回復は見込んでおらず、中国における回復も緩やかなものになると想定している。
Q&Aセッションでは、競争上の敗北も取り上げられた。シンガポールの「PRECISE」プログラムにおいて、現行フェーズの40万サンプル中の最初の20万サンプルはIlluminaが受注し、その一部がUltima Genomicsに割り当てられた。ヴァン・オーン氏は、残りの部分において「DNA、RNA、あるいはその両方でロングリードのコンポーネントが採用されるという楽観的な見方を維持している」と述べたが、PacBioには何も割り当てられていない。
利益率の悪化、多額のキャッシュバーン、そしてCFOの退任
非GAAP（一般会計原則非適用）ベースの売上総利益率は36%となり、前年同期の42%から低下した。メイヤー氏は、メモリーコストの上昇とVegaの製造移行コストをその理由に挙げた。通期見通しの35%〜37%という数値は、短期的な改善が見込めないことを示唆している。非GAAPベースの営業費用は13%減の4,700万ドルとなり、リストラによる削減効果を反映して、通期の営業費用見通しは従来の2億1,500万〜2億2,000万ドルから2億3,000万〜2億7,000万ドル（※原文書では2億300万〜2億7,000万ドル）へと引き下げられた。従業員数は445人で、1年前の491人から減少した。非GAAPベースの当期純損失は3,280万ドル（1株あたり0.11ドル）であった。
現金および投資資産の残高は四半期末時点で1億9,940万ドルとなり、2025年末の2億7,950万ドルから減少した。UBSの試算によると、第3四半期のキャッシュバーン（現金流出額）は約3,700万ドルであった。メイヤー氏はその一部を、買付債務や第3四半期終盤に認められた「数件の支払い期日延長」を含む運転資本のタイミングに起因するものとした。年末の現金残高予想である1億7,500万〜1億8,500万ドルは、第4四半期のキャッシュバーンが約1,500万〜2,500万ドルになることを示している。これは急激な減少ペースの鈍化であり、運転資本の回収に大きく依存している。
また同社は、約1.5年間同職を務めてきたCFOのジム・ギブソン（Jim Gibson）が退任すると発表した。後任の選任作業を進めており、当面の間はメイヤー氏が主席会計責任者を兼務する。2029年満期の2億ドルの転換社債と2030年満期の4億ドルの転換社債を抱える中でのCFOの退任は特筆すべき事象である。ヴァン・オーン氏は、「満期への早急な対応の必要はなく」、保有者も柔軟性を示していると述べた。経営陣は依然として、1,500万〜2,000万ドルの人件費削減と、高スループットプラットフォームの開発費縮小によるさらに1,500万〜2,000万ドルの削減を背景に、2028年のキャッシュフロー黒字化を目標としている。
高スループットプラットフォームの投入時期が重要な変数に
ヴァン・オーン氏は、高スループットシステムの開発は「順調に進んでおり」、来年末までの商業化が見込まれていると述べ、リストラ後も開発チームには十分なリソースが確保されていると強調した。同氏は、このプラットフォームがBerryプログラムのようなプロジェクトに自然に適合するものであるとし、PacBioは「これを見越して、現在こうした大規模プログラムの一部に対して戦略的な価格設定を行っている」と述べた。このことは、現在の取引の一部がRevioにおいて薄利であることを意味している。36%という売上総利益率と相まって、これは新しいプラットフォームが登場するまでに大規模プログラムがどの程度の利益率をもたらすかという疑問を生じさせる。利益率、プルスルー、そしてAIのテーゼの観点からプラットフォームの投入は極めて重要であり、2028年の黒字化目標は遅延の許されない状況にある。