Quantum-Si、Proteusの発売を2027年第2四半期に延期 プラットフォームの信頼性向上へ人員2割削減
2026年第2四半期決算説明会（8月13日開催）
Quantum-Siは第2四半期決算説明会において、主力タンパク質シーケンシング・プラットフォーム「Proteus」の発売時期を2026年末から2027年第2四半期へ延期すると発表した。これに伴い、同社は全従業員の20%を削減し、プログラムのリーダーシップ体制を再編する。CEOのJeffrey Hawkins氏は今回の決定について、スピードよりも信頼性を優先させる「意図的なトレードオフ」であると説明。「製品の準備が完全に整う前に進めるよりも、生産開始前にプラットフォームのリスクを排除（デリスク）することを選んだ」とアナリストらに語った。
延期の理由は「製造の再現性」 技術的リスクではないと強調
同社は、今回の延期が基盤となる科学技術に対する疑念ではないことを明確にした。Hawkins氏は「統合ユニットから十分なシーケンシング・データを取得できており、基盤技術には確信を持っている」と述べ、準備された声明の中でこの点を2度繰り返した。課題となっているのは、2026年に入ってから製造された統合ユニット群における「再現性」だ。一部の機器は社内仕様を上回る性能を示す一方、目標を下回るものもあり、追加の設計サイクルを設けることで生産規模拡大前に性能プロファイルを統一する狙いがある。また、光学モジュールの製造容易化に向けた設計改善や、機器への統合プロセスについても言及。これらは「当初の予想よりも難しく、時間を要する」作業であり、製造と統合をそれぞれ別のパートナーが担っていることが影響していると説明した。
経営陣は、この変更が顧客からのフィードバックに応じたものではなく、内部的な判断であることを強調した。Alliance Global Partnersのアナリスト、Scott Henry氏に対し、Hawkins氏は「顧客から新たな要望が寄せられ、計画になかった機能追加が必要になったわけではない」と回答した。なお、延期はハードウェアに限定される。CFOのJeffry Keyes氏は、試薬や消耗品開発については「ハードウェアの進捗に大きく依存する」としつつも、酵素「Recognizer」やライブラリー調製ワークストリームは計画通りに進んでいると明言した。
アミノ酸検出数は18から19〜20へ拡大
延期によるポジティブな側面として、Proteusの発売時には18種類ではなく、19または20種類のアミノ酸を検出可能になる見通しが示された。当初は2026年末に18種類で発売し、20種類への対応は2027年以降を予定していた。Hawkins氏は、18から20への移行による実用上のメリットは多くの用途で限定的であると率直に認めた。検出される追加のアミノ酸は自然界での存在比が低いためだ。「20種類すべてが必要な一部の用途を除けば、市場が大きく広がるわけではない」とし、DNAにおけるSNPアレイから全ゲノムシーケンシングへの移行になぞらえ、科学的なブレイクスルーというよりも「営業上の摩擦を取り除くこと」に価値があると述べた。Maxim Groupのアナリスト、Michael Okunewitch氏が「『なぜ18種類では不十分なのか』を説明する必要がなくなる」と指摘した通りである。
ライブラリー調製の新戦略：汎用キットから用途別スイートへ
今回の説明会で明かされた最も実質的な戦略的転換は、タンパク質をペプチドに分解してシーケンシング・アレイに結合させる「ライブラリー調製」に関するものだ。これまで同社は、あらゆるタンパク質タイプに対応する単一の汎用キットを構築してきた。しかし、「Platinum」の導入現場で得られた実データに基づき、用途別のキット群へ方針を転換する。Hawkins氏は、単一キットですべてのタンパク質タイプやワークフローを「最適に」処理しようとするのは、目的別のキット群を構築するよりも本質的に困難であると指摘。これにより、開発面での技術的リスクと、顧客側の最適化負担の両方を軽減できると主張した。このライブラリー調製スイートは、Proteusと同時に発売される予定だ。
非ヒト・プロテオミクス市場の機会は40億ドル超
Quantum-Siは、Platinumの商用展開を通じて、これまで公表してこなかった「非ヒト・プロテオミクス（病原体検出、農業研究、バイオセキュリティなど）」の市場規模を初めて定量化した。経営陣は、病原体および農業研究セグメントだけで年間40億ドル以上の機会があると試算。環境、動物衛生、産業、食品などの用途は含めておらず、Hawkins氏は「保守的な数字」と述べた。同社は、米海軍研究所が病原体・毒素検出に同社のシーケンシング技術を使用した研究論文や、米軍および米国外の軍関係者との活発な連携を挙げた。戦略的論拠として、これらの市場には比較対象となる参照配列が存在しないことが多く、これが競合技術の弱点となる一方、Quantum-Siの単一分子かつ参照不要のアプローチには追い風になると分析している。
ヒト関連では、欧州のバイオ医薬品企業が遺伝子治療薬製造におけるAAV（アデノ随伴ウイルス）の血清型判定にタンパク質シーケンシングを応用している事例が紹介された。Platinumでも血清型間のアミノ酸の違いは検出できたが、日常的な使用にはシーケンシングの深さが不足していたという。Proteusのナノウェル数増加に基づいたモデリングでは、この感度基準をクリアできる見込みであり、現在150社以上のバイオテク・製薬企業がAAVベースの遺伝子治療を開発している点も強調された。
売上高は依然として低水準、リセット後もガイダンスを維持
商用数値は、同社が依然として初期段階にあることを浮き彫りにしている。第2四半期の売上高は34万4,000ドルで、前年同期の59万1,000ドルから減少。上半期の売上高も140万ドルから60万2,000ドルへ落ち込んだ。粗利益率は当四半期で50%だったが、年初来では41%にとどまる。経営陣は、顧客がProteusを待機しているため、Platinumの短期的な資本販売を意図的に制限したことが減収の要因だと説明した。純損失は2,350万ドル（前年同期は2,880万ドル）に縮小し、調整後EBITDAもマイナス2,120万ドル（前年同期はマイナス2,220万ドル）へとわずかに改善した。ロードマップの変更にもかかわらず、同社は2026年通期のガイダンス（売上高約100万ドル、調整後営業費用9,800万ドル以下、総キャッシュ使用額9,300万ドル以下）を維持した。
コスト削減で2028年第4四半期まで資金繰りを確保
全従業員の約20%を削減する人員整理により、完全に実施されれば年間約1,200万ドルの営業費用削減が見込まれる。退職金コストを吸収した後、第4四半期から効果が現れる見通しだ。6月30日時点で1億6,990万ドルの現金・現金同等物および市場性証券を保有しており、これにより2028年第4四半期まで資金繰りが可能となった。これは、差し迫った増資を行わずにさらなる遅延を吸収できる重要な猶予となる。Keyes氏は、プログラムに不可欠な支出は保護されるため、研究開発費は「以前の四半期と比較的同水準」を維持すると述べた。
早期アクセスおよび顧客サンプル評価は2027年に延期
ハードウェアの遅延に伴い、正式に開始されていなかった「早期アクセスプログラム」は、2026年末ではなく2027年初頭の開始が濃厚となった。経営陣は、それ以前に顧客サンプル評価プログラムを開始したい意向を示しているが、具体的な時期は未定。当面の間は、既存の配置プログラムを通じて見込み客との関係を維持する方針だ。このプログラムでは、顧客は資本購入なしで旧世代機器を試用できる。
Proteusへの移行で半導体依存が低減
質疑応答の中で明らかになった構造的なプラス要因として、半導体ファウンドリーの生産能力や価格に対する消耗品の依存リスクが、Proteusへの移行により実質的に解消される点が挙げられた。PlatinumのCMOSチップベースの消耗品とは異なり、Proteusの消耗品は溶融シリカガラスアレイであるためだ。Hawkins氏は、オンボードデータ解析用のGPU消費については依然として「小規模なプレイヤー」であり、業界全体のリードタイムが長いため生産開始前に在庫を積み増す計画だが、チップのインフレがProteusの増産に対する重大な制約になるとは考えていないと述べた。