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긴고 바이오웍스, 대학 자율형 실험실 4곳 수주 및 해외 CRO 가격 경쟁력 우위… 매출 48% 급감 속 실적 가시성은 여전히 불투명

2026년 2분기 실적 컨퍼런스콜(2026년 8월 5일): 신규 학술 부문 수주와 ADME-One 출시, 또 한 번의 가파른 매출 감소세 가려

긴고 바이오웍스(Ginkgo Bioworks)는 2분기 실적 컨퍼런스콜에서 축소되는 서비스 사업 부문에서 벗어나 자율형 실험실(autonomous lab) 전략으로 논점의 전환을 시도했다. 회사는 실적발표 전날 MIT, 캘리포니아공대(Caltech), 메릴랜드대학교, 노스웨스턴대학교에 자율형 실험실을 구축할 공급업체로 선정되었다고 발표했다. 캘리포니아공대, 메릴랜드대, 노스웨스턴대는 미 국립과학재단(NSF) 프로그램으로부터 자금을 지원받으며, MIT는 별도의 연구비를 통해 진행된다. 이번 수주는 지금까지 주로 단 하나의 국립연구소 계약에만 의존해왔던 논거에 상업적 증거를 더해준다. 경영진은 계약 금액이나 수주 잔고(backlog), 매출 가이던스를 제시하지 않아 기회의 규모는 아직 가늠하기 어려운 상황이다.

대학 수주로 자율형 실험실 고객 기반 다변화

이번에 선정된 4곳의 연구 분야는 각각 차별화된다. 캘리포니아공대는 천연물 화합물로부터 화학 구조 데이터 생성을, 노스웨스턴대는 단백질 공학을, 메릴랜드대는 바이오제조를, MIT는 교육 분야에 집중할 예정이다. 제이슨 켈리(Jason Kelly) 최고경영자(CEO)는 4곳 모두 동일한 기반 플랫폼 위에서 구동될 것이라고 강조했다. 그는 대학들이 사용하는 장비의 약 60~70%는 공통적이며, 분야별로 특화된 장비는 30~40%에 불과하다고 설명했다. 그의 영업 제안은 파격적이다. "모든 생물학과에 거대한 '자율형 LabCorp'를 두고 기존 실험실의 대부분을 폐쇄할 수 있다는 구상입니다. 데이터 센터의 컴퓨팅 파워를 빌려 쓰는 것과 비슷한 느낌이 들 것입니다."

켈리 CEO는 미 국립보건원(NIH)의 연간 약 400억 달러 규모의 연구비 지출과 NSF, 미 국방고등연구계획국(DARPA)의 예산을 잠재적 시장 규모로 지목했다. 그는 첫 번째 배치(batch)가 성공적으로 작동할 경우 이러한 시스템이 없는 기관들 사이에 "강한 포모(FOMO·소외 공포)가 생길 것"으로 기대한다고 밝혔다. 또한 대학들이 신규 연구비뿐만 아니라 실험실 간접비 예산나 기부금을 통해 구매 자금을 조달할 수 있을 것이라고 주장했다. 이는 그럴듯하지만 아직 입증되지 않은 주장이다. 대학의 조달 주기는 느린 편이며, 이들 고객은 대거 연방정부 예산에 의존하고 있기 때문이다.

켈리 CEO는 백악관 과학기술정책실(OSTP)의 새로운 과학 전략을 언급했는데, 여기에는 클라우드 실험실 국가 네트워크 구축을 위한 4억 달러 규모의 NSF 프로그램과 폐루프(closed-loop) 자율형 실험에 대한 명시적인 내용이 포함되어 있다. 긴고는 또한 퍼시픽노스웨스트 국립연구소(PNNL)에서의 초기 작업 사례를 언급하며, 지난해 12월 첫 13개의 RAC(Robot-Assisted Cell) 전환을 마쳤고 제네시스 미션(Genesis Mission)에 따라 97개로 확장을 계획 중이라고 밝혔다.

우시앱텍과 서구권 CRO를 겨냥한 가격 공세, ADME-One

가장 구체적인 신규 상용 제품은 약 6주 전에 출시된 ADME-One이다. 이는 저분자 화합물을 대상으로 하는 5가지 Tier 1 흡수·분포·대사·배설(ADME) 분석 패널이다. 긴고는 데이터포인츠(Datapoints) 사업부를 통해 이를 199달러에 공급하고 있다. 켈리 CEO는 서구권 계약연구기관(CRO)들이 이 패널에 대해 2,000~5,000달러를 청구하고, 중국계 업체들은 1,000~2,500달러를 받는다고 전했다. 약동학 예측 분야의 인덕티브 바이오(Inductive Bio) 및 화합물 관리 분야의 탱저블 사이언티픽(Tangible Scientific)과의 제휴를 통해 이 제품군을 "기존 가격의 10분의 1 수준"으로 묶어 제공하고 있다.

경영진은 동역학적 용해도, 투과도, 미소체 안정성, P450 저해, 혈장 단백 결합 전반에 걸쳐 스피어만 순위 상관관계를 활용해 외부 벤더들과 분석법 검증을 마쳤다고 밝혔다. 또한 320개 화합물로 구성된 LOPAC 라이브러리 관련 데이터도 공개했다. 켈리 CEO는 외부 기업인 인플렉사 AI(Inflexa AI)가 해당 데이터를 검토한 결과 기술적으로 결함이 없음을 확인했다고 전했다. 그는 "기술적 역량과 처리 용량 측면에서 우시앱텍(WuXi)에 전혀 뒤지지 않으며 가격 면에서는 압도하고 있다고 생각한다"고 잘라 말했다.

초기 시장 반응은 주목할 만하지만 아직 수치화되지는 않았다. 켈리 CEO는 출시 후 첫 6주 동안 약 16곳의 고객을 확보했으며, 이 중에는 신규 고객사도 포함되어 있다고 밝혔다. 그는 이 카테고리의 중요성에 대해, AI 기반 데이터 생성은 보통 캠페인 형태로 유입되는 반면 ADME 작업은 제약사 연구팀이 분자 개발을 진행함에 따라 지속적으로 발주되기 때문이라고 설명했다. "전통적인 CRO 시장을 공략하는 것도 상당히 기대됩니다. 수요가 꾸준히 발생하는 원천이기 때문입니다. 하지만 이 분야에서는 우리가 신참이므로 실력으로 증명해 보여야 합니다." 패널당 199달러라는 가격을 감안할 때 단기적인 매출 기여도는 미미할 것으로 보이며, 긴고는 단위 마진에 대해서는 언급하지 않았다. 향후 플레이트 기반 화학 합성 및 혐기성 챔버를 추가할 계획이며, 이를 통해 중국계 CRO 매출의 큰 비중을 차지하는 화학 합성 영역으로 서비스 확장을 꾀하고 있다.

네뷸라, 3주 만에 용량 두 배 확충

긴고의 보스턴 실험실인 네뷸라(Nebula)는 약 3주 만에 50개의 RAC를 추가하여 현재 총 105개를 보유하고 있다. 켈리 CEO는 이 RAC들이 첨단 제조 공정에서 사전 제작된 후 실험실에 설치, 연결 및 디버깅을 거쳐 실험에 투입되었다고 밝혔다. 그는 이러한 구축 일정은 전통적인 워크셀(work cell) 자동화 분야에서는 전례가 없는 일이라고 평가했다. 평상시에는 자동화 엔지니어가 아닌 과학자들이 제출한 약 30개의 고유 프로토콜이 시스템 전반에서 구동되며, 장비 간 복제본을 합치면 그 수는 100개를 넘어선다. 켈리 CEO는 시스템에 버트가 전혀 없는 것은 아니라고 시인했다. "버그가 없다거나 해결해야 할 문제가 없다는 뜻은 아닙니다. 당연히 존재합니다." 스케줄러와 견고성(robustness)이 주요 엔지니어링 과제다.

켈리 CEO는 이러한 경제성을 운송 수단에 빗대어 설명했다. 워크셀은 고도로 자동화되어 있으나 유연성이 떨어지는 지하철에 비유할 수 있고, 수동 벤치는 유연하지만 인력에 의존하는 승용차에 비유할 수 있다. 긴고는 자동화와 유연성이 결합된 '웨이모(Waymo)'를 구축하려 노력하고 있다는 것이다. 그는 제약업계가 연구에 연간 지출하는 600억~800억 달러 중 95% 이상을 수동 벤치가 차지하고 있다고 말했다. 또한 자율형 실험실은 장비 점유 공간을 약 3분의 1 수준으로 줄이고, 수동 실험실이 주당 약 40시간 가동되는 데 비해 주당 168시간 가동된다고 덧붙였다. 회사는 또한 잠재 고객들이 시스템 도입을 확정하기 전에 네뷸라에서 자사 프로토콜을 직접 구동해 볼 수 있는 '선체험 후구매(try-before-you-buy)' 옵션도 제공하고 있다.

재무 실적: 매출 급감 속 현금 소모 가이던스 유지

핵심 사업은 여전히 축소되고 있다. 4월 3일 매각된 바이오보안 사업부를 제외한 2분기 계속사업 매출은 2,000만 달러로 전년 동기 대비 48% 감소했다. 상반기 매출은 4,000만 달러로 49% 감소했으며, 전년 동기의 비현금성 바이오에딧(BiomEdit) 계약 해지 수수료 7.5기밀만 달러를 제외하면 약 42% 줄어든 수준이다. 조정 상각전영업이익(EBITDA)은 마이너스 3,600만 달러로 전년 동기의 마이너스 2,500만 달러보다 적자가 확대되었다. 계속사업 순손실은 5,700만 달러로 전년 동기 5,300만 달러 대비 확대됐다. 연구개발비(R&D)는 3,000만 달러로 4% 감소했고, 판매관리비(SG&A)는 2025년 말 완료된 구조조정의 영향으로 1,200만 달러로 26% 감소했다.

현금 소모액(cash burn)은 2분기 4,500만 달러로 전년 동기 3,800만 달러보다 늘었으며, 상반기 기준으로는 930만 달러로 3% 감소했다. 상반기에는 구글 클라우드(Google Cloud) 대금 1,400만 달러가 포함되어 있다. 해당 약정의 재조정으로 최소 의무 금액이 1억 달러 이상 줄어들었고 계약 기간도 3년에서 6년으로 연장됐다. 조정 EBITDA에는 분기당 1,400만 달러의 초과 리스 비용이 반영되어 있으며(기존 1,200만 달러에서 증가), 경영진은 전대를 통해 이를 완화할 수 있을 것이라고 밝혔다.

회사는 2026년 현금 소모 가이던스로 1억 2,500만~1억 5,000만 달러를 재확인했다. 이는 하반기 현금 소모액이 약 3,200만~5,700만 달러로 상반기 대비 대폭 감소할 것임을 시사하며, 켈리 CEO는 하반기 현금 소모가 더욱 개선될 것이라고 언급했다. 긴고는 2분기 말 기준 현금 및 현금성 자산 3억 200만 달러와 제한예금 870만 달러를 보유하고 있다. 또한 분기 중 시장가 발행(At-The-Market) 프로그램을 통해 1,700만 달러를 조달하여, 주식 가치 희석(dilution)이 여전히 자금 조달 수단으로 활용되고 있음을 보여주었다.

매출 가시성이 여전히 핵심 과제

TD코웬의 브랜던을 비롯한 애널리스트들은 자율형 실험실과 데이터포인츠의 매출 세부 내역을 거듭 질의했으나, 경영진은 구체적인 답변을 피했다. 긴고는 매출 가이던스를 제공하지 않으며, 자율형 실험실이나 데이터포인츠 매출을 별도로 세분화하여 공개하지도 않는다. 스티브 코언(Steve Coen) 최고재무책임자(CFO)는 현금이 조기에 유입되더라도 하드웨어 매출은 납품 및 설치 시점에 인식된다고 설명했다. 대규모 정부 프로젝트는 여전히 초기 계약에 따른 소규모 매출만 발생하는 이른바 '계획 조율 단계(planning coordination phase)'에 머물러 있다. 서비스 및 소프트웨어 라이선싱은 배포 이후에 뒤따른다. 데이터포인츠 매출은 3~9개월 소요되는 프로젝트에 걸쳐 기간별로 인식되며, 이는 과거의 솔루션 계약에 비해 규모가 작다고 코언 CFO는 덧붙였다.

이는 PNNL 확장 사업 및 대학 실험실에서 발생하는 불규칙한 장비 매출이 설치 완료 후에야 반영되는 반면, 기존 서비스 사업 기반은 계속해서 줄어들고 있음을 시사한다. 경영진은 또한 재주문율(repeat order rates) 공개도 거부하며, 계약은 일반적으로 개념증명(PoC)으로 시작해 고객이 만족할 경우 확장되는 방식이라고만 언급했다. 투자자들은 입소문에 의한 강력한 모멘텀은 있으나 공개된 재무적 증거는 부족한 이번 사업 전환에 베팅할 것을 요구받고 있는 셈이다.

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